病原mNGS病例分享一跤摔出脓毒血症,原

一名76岁的中老年男性外出散步时不慎掉进河沟,右手大鱼际部位划破,伤口2mm,流血少许,当天晚上出现寒战,咳嗽咳痰,次日自觉右手红肿热痛,伴寒战,发热,医院就诊。

CT显示两侧慢性支气管炎改变,两肺坠积性改变,予阿莫西林克拉维酸抗感染,补液支持治疗,无缓解;手部伤口覆有黄脓液,周围皮肤红热并压之疼痛,以“右手外伤3天”收入院。

▌入院检查:

实验室检查结果如下:

为进一步诊治,收入急诊监护室。

▌初步诊断:

1、手部感染:有手外伤史,手部有红肿热痛表现,血炎症指标高,故诊断;

2、脓毒血症:有明确感染部位,SOFA评分5分,故诊断;

3、肺部感染:CT提示两侧慢性支气管炎改变,两肺坠积性改变,故诊断。

预判病原体:

①金黄色葡萄球菌:该患者手部受伤后皮肤软组织感染,首先考虑金黄色葡萄球菌感染可能。伤口流黄脓液、伴周围皮肤红肿热痛,白细胞及中性粒细胞增高,符合金葡菌感染的一般特征,但仍有待于脓液培养鉴定,病原宏基因组学(mNGS)检测等以明确。

②破伤风芽孢梭菌:该患者伤口窄而深,还需考虑破伤风芽孢梭菌感染可能。破伤风潜伏期从几天至几周不等,具有牙关紧闭、角弓反张等特征,但该患者无相关临床表现,有待完善手部脓液涂片及病原宏基因组学(mNGS)检测,随访病情变化等进一步明确。

③非结核分枝杆菌:该患者在水中划伤手部,也需警惕非结核分枝杆菌感染可能。该病潜伏期长,局部可有红斑、丘疹、脓疱、结节等多种疾病,明确诊断依靠培养或病原宏基因组学(mNGS)检测。

▌病原检查:

患者脓液行病原学检查,结果如下:

同时患者手部脓液送往实验室进行病原体宏基因组测序。隔日检测结果回报检出维氏气单胞菌特异性序列数条,相对丰度99.3%。

综合mNGS的检测结果,考虑维氏气单胞菌感染可能性大。因此在手部伤口切开引流的同时使用三代头孢和甲硝唑抗感染针对性治疗,患者各项指标恢复明显。

由于不同种气单胞菌菌种致病力相差大,相比于培养,该病例凸显mNGS在病原体鉴种分型上的优势。华银健康mNGS检测,为临床感染性疾病诊断提供快速、准确、全面的检测服务。

维氏气单胞菌

单胞菌为水生生态系统的常居菌,广泛分布于地下水,水库,清洁或污染的湖泊或河流等。正由于不同种气单胞菌菌种致病力相差很大,临床一般要求将分离自无菌部位(血液和脑脊液)和严重伤口感染的菌株鉴定到种。

维氏气单胞菌就是一种重要的人、兽及水生生物共患病原菌,其不但可感染鱼类、两栖动物和爬行动物,也可感染包括人在内的哺乳动物,特别是老年人、儿童及免疫力低下的人群,不仅给水产养殖业造成了巨大经济损失,同时也威胁着人类的健康。有患者外伤性损伤后接触水源引起伤口感染,坏死性筋膜炎、败血症等疾病的报道。

—END—

供稿:高通量测序事业部

编辑:汪妍君

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